細胞的染色法
細胞經甲基綠一呱咯寧混合液處理后，其中的 DNA 和 RNA 出現不同的呈色反應，一般認為這是由于帶有負電荷的核酸對堿性染料呱咯寧和甲基綠具有親和力，且這兩種染料的作用有選擇性，甲基綠染高聚分子的 DNA 呈藍綠色，呱咯寧染低聚分子的 RNA 呈紅色。由此對細胞中的 DNA 和 RNA 進行定位、定性、和定量分析。
由于不同的蛋白質分子所帶的堿性和酸性基團的數目不同，在 pH 值不同的溶液中，蛋白質分子所帶的凈電荷多少不同。如在生理條件下，整個蛋白質所帶負電荷多，則為酸性蛋白質；帶正電荷多，則為堿性蛋白質。據此，可將標本經三氯醋酸處理提出核酸后，用不同 pH 值的固綠染液分別染色，細胞內的酸性蛋白和堿性蛋白質顯示出來。
過氧化物酶能把許多胺類氧化為有色化合物，用聯苯胺處理標本，細胞內的過氧化物酶能把聯苯胺氧化為藍色的聯苯胺藍，進而變為棕色產物，因而可以根據顏色反應來判定過氧化物酶的有無或多少。
組織、細胞的多糖、粘多糖及粘蛋白等都可用 PAS 法來顯示，其化學基礎是利用過碘酸的氧化作用，打開碳鏈形成醛，生成的醛基與 Schiff 試劑中的無色品紅反應形成紫紅色化合物。